一家公司传统的项目实施方法是预测型的，为了适应商业环境的快速变化，公司正在推广敏捷方法，并且选择了一个项目作为试验对象。现在项目经理正在敏捷教练的指导下使用敏捷方法。第三次迭代的回顾会议上，团队反映了很多公司存在的组织层面的问题，这些问题形成了项目推进的障碍。针对这种情况，项目经理应该怎么做（）。